Un flagelo es un apéndice movible con forma de látigo presente en muchos organismos unicelulares y en algunas células de organismos pluricelulares. Un ejemplo es el flagelo que tienen los espermatozoides. Usualmente los flagelos son usados para el movimiento, aunque algunos organismos pueden utilizarlos para otras funciones. Por ejemplo, los coanocitos de las esponjas poseen flagelos que producen corrientes de agua que estos organismos filtran para obtener el alimento. Existen tres tipos de flagelos: eucarióticos, bacterianos y arqueanos. De hecho, en cada uno de estos tres dominios biológicos, los flagelos son completamente diferentes tanto en estructura como en origen evolutivo. La única característica común entre los tres tipos de flagelos es su apariencia superficial. Los flagelos de Eukarya (aquellos de las células de protistas, animales y plantas) son proyecciones celulares que baten generando un movimiento helicoidal. Los flagelos de Bacteria, en cambio, son complejos mecanismos en los que el filamento rota como una hélice impulsado por un microscópico motor giratorio. Por último, los flagelos de Archaea son superficialmente similares a los bacterianos, pero son diferentes en muchos detalles y se consideran no homólogos.

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A flagellum (/fləˈdʒɛləm/; plural: flagella) is a lash-like appendage that protrudes from the cell body of certain prokaryotic and eukaryotic cells. The word flagellum in Latin means whip. The primary role of the flagellum is locomotion, but it also often has function as a sensory organelle, being sensitive to chemicals and temperatures outside the cell. Flagella are organelles defined by function rather than structure. Large differences occur between different types of flagella; the prokaryotic and eukaryotic flagella differ greatly in protein composition, structure, and mechanism of propulsion. However, both can be used for swimming. An example of a flagellate bacterium is the ulcer-causing Helicobacter pylori, which uses multiple flagella to propel itself through the mucus lining to reach the stomach epithelium. An example of a eukaryotic flagellate cell is the mammalian sperm cell, which uses its flagellum to propel itself through the female reproductive tract. Eukaryotic flagella are structurally identical to eukaryotic cilia, although distinctions are sometimes made according to function and/or length. Fimbriae and pili are also thin appendages, but have different functions and are usually smaller.

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