El micelio es la masa de hifas que constituye el cuerpo vegetativo de un hongo.Dependiendo de su crecimiento se clasifican en reproductores (aéreos) o vegetativos. Los micelios reproductores crecen hacia la superficie externa del medio y son los encargados de formar los orgánulos reproductores (endosporios) para la formación de nuevos micelios. Los micelios vegetativos se encargan de la absorción de nutrientes, crecen hacia abajo, para cumplir su función. Los cuerpos vegetativos de la mayoría de los hongos (y, por tanto, el de los líquenes) están constituidos por filamentos unicelulares denominados hifas. Las hifas crecen tan solo apicalmente en el ápice. Las hifas pueden crecer con mucha rapidez, hasta más de 1 mm por hora. Por este motivo y por las frecuentes ramificaciones surge en el sustrato una maraña de hifas con una enorme superficie: el micelio. Como las hifas no están cutinizadas, el micelio es muy sensible a la desecación, pero, por otra parte, están muy capacitadas para absorber osmotróficamente las sustancias disueltas. Este hecho lo aprovechan muchas plantas superiores formando simbiosis con los hongos. Las hifas de los hongos inferiores no son septadas (no presentan divisiones), organización sifonal. Las hifas de los hongos superiores presentan septos, divididas en cámaras y células; pero con perforaciones, por lo que también en estos hongos el plasma forma un continuo.

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Mycelium is the vegetative part of a fungus or fungus-like bacterial colony, consisting of a mass of branching, thread-like hyphae. The mass of hyphae is sometimes called shiro, especially within the fairy ring fungi. Fungal colonies composed of mycelium are found in and on soil and many other substrates. A typical single spore germinates into a homokaryotic mycelium, which cannot reproduce sexually; when two compatible homokaryotic mycelia join and form a dikaryotic mycelium, that mycelium may form fruiting bodies such as mushrooms. A mycelium may be minute, forming a colony that is too small to see, or it may be extensive: Is this the largest organism in the world? This 2,400-acre [970-hectare] site in eastern Oregon had a contiguous growth of mycelium before logging roads cut through it. Estimated at 1,665 football fields in size and 2,200 years old, this one fungus has killed the forest above it several times over, and in so doing has built deeper soil layers that allow the growth of ever-larger stands of trees. Mushroom-forming forest fungi are unique in that their mycelial mats can achieve such massive proportions.— Paul Stamets, Mycelium Running Through the mycelium, a fungus absorbs nutrients from its environment. It does this in a two-stage process. First, the hyphae secrete enzymes onto or into the food source, which break down biological polymers into smaller units such as monomers. These monomers are then absorbed into the mycelium by facilitated diffusion and active transport. Mycelium is vital in terrestrial and aquatic ecosystems for their role in the decomposition of plant material. They contribute to the organic fraction of soil, and their growth releases carbon dioxide back into the atmosphere (see carbon cycle). Ectomycorrhizal extramatrical mycelium, as well as the mycelium of Arbuscular mycorrhizal fungi increase the efficiency of water and nutrient absorption of most plants and confers resistance to some plant pathogens. Mycelium is an important food source for many soil invertebrates. "Mycelium", like "fungus", can be considered a mass noun, a word that can be either singular or plural. The term "mycelia", though, like "fungi", is often used as the preferred plural form. Sclerotia are compact or hard masses of mycelium.

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